杭州市第三人民医院泌尿外科成立于2003年，目前是杭州市设备齐全的泌尿外科微创治疗中心，在泌尿系疾病诊疗技术方面，特别是对各种泌尿系结石、前列腺增生症、各种原因尿失禁、泌尿系肿瘤及小儿泌尿外科的腔内治疗方面在省内处于领先水平。泌尿外科现有床位20张，职称医生4人，中级职称4人，设有泌尿外科治疗中心，内镜诊疗工作站，拥有trimedyne钬激光系统、Arcovis2000C臂X线机、瑞士EMS气压弹道碎石机、复式脉冲体外震波碎石机、英国“佳乐”等离子体双极内窥镜系统、腹腔镜、超声刀、硬性输尿管镜、STORZ系列腔内镜、尿流动力仪、生物反馈治疗仪等先进医疗器械设备。使许多患者避免了开大刀的窘迫。

开展了腹腔镜手术治疗肾肿瘤、肾上腺肿瘤、肾囊肿等疾病，复式脉冲体外震波碎石，腔镜下钬激光碎石、气压弹道碎石，经尿道前列腺电切、汽化，等离子体前列腺切除、汽化，钬激光前列腺剜术，微创治疗压力性尿失禁，内镜下手术结合放化疗或性的膀胱切除、可控性尿流改道术等。尤其是经尿道前列腺电切、汽化手术，输尿管镜及经皮肾镜技术，各类尿失禁的综合治疗技术在省内居先进水平。