莆田市医院五官科分为耳鼻咽喉及眼科两个专业组。拥有日本OLYMPUS鼻窦内窥镜及监视影像系统、日本OLYMPUS纤维鼻咽喉镜、德国LEICA手术显微镜、丹麦MEDSON纯音测听计、丹麦MEDSON中耳分析仪、丹麦MEDSON诊断型耳声发射仪、符合听力室检测标准的听力室、耳鼻咽喉多功能诊疗台2台、鼓膜按摩仪、支撑喉镜、气管镜、食道镜。鼻窦内窥镜下筛窦骨瘤切除术是我市首例报告、面神经减压术是我市首例开展、颈外径路声带麻痹声带外展固定术以及口内径路咽旁间隙肿瘤切除均为我市首例手术。科室设有眼科门诊室、治疗室、暗室、视力检查室、验光室、视野室、病房，环境舒适。拥有TOPCON非接触眼压记2台、TOMEY电脑验光仪1台、全自动电脑视野记1台、裂隙灯图像分析系统1套、ALCON超声乳化仪UⅡ1台、苏州六六YZ20T5显微镜1台、比利时TUPTNAUER高压消毒锅1个、裂隙灯2台、YA-6直接检眼镜2台、带状检影镜2台、倒睫电解仪1台、沙眼治疗仪1台、冷冻器1台、电磁铁1台、眼科显微器械数套。可进行各种眼科手术，特别是翼状胬肉结膜移植术、复发性翼状胬肉羊膜移植术、丝裂霉素局部运用+小梁切除术治疗新生血管性等难治性青光眼、白内障超声乳化+人工晶体植入术、眼内容物剜出术+义眼台植入术、球内异物取出术、眼内硅油取出术、视网膜脱离冷凝+环扎+外加压等处于全市领先水平，部分达到国内先进水平。开展的新技术有板层或全层角膜移植术，玻璃体切割术，泪道激光术，鼻内窥镜下鼻腔泪囊吻合术。