五官科创建于1998年，科室拥有GX—Ⅲ多功能电离子手术治疗仪、食道镜、支撑喉镜、电测听、中心视野仪、裂隙灯、显微镜、冷光源、眼压计、眼底镜、超声雾化仪、奥林巴斯鼻咽喉镜(筹)、电脑眼光仪(筹)及常规诊断手术器械等。

积极开展对外交流，与福建医科大学附属二院，泉州一院建立技术协作关系，此外，科室还与厦门眼科中心、180医院眼科、福建医科大学附属一院五官科建立友好协作关系，定期邀请上述医院前来指导、会诊。