消化内科是被舟山市人民确定的全市首批5个医学重点学科之一。拥有主任医师1名，副主任医师2名，主治医师3名。学科带头人邵伟是浙江省消化学会委员、浙江省消化内镜学会会员、浙江省消化中心舟山市组组长、医学硕士、普陀区首届“中青年名医”。

消化内科是以内镜技术、微创技术、介入技术作为学科发展方向，拥有国内的设备。开展了肝癌的介入治疗、十二指肠镜胆总管结石取出术、胆道支架放置术、食道支架放置术、金属钛夹治疗急性消化道出血等。

目前消化内科承担省卫生厅及市科技局等5项课题，多项科研获省卫生厅、舟山市科技进步二、三等奖。消化科多次被评为舟山市重点学科二等奖。