呼吸内科为南华大学硕士研究生培养基地，2006年遴选为湖南省马王堆医院首批重点学科，2009年开始进行重点学科第二周期建设。

学科集呼吸系统疾病的医疗、科研、教学三位于一体，分为临床、实验研究、专科检查三大板块。临床板块包含社会医疗区（九病室呼吸内科）、干部医疗区（五病室三区呼吸内科）、呼吸重症监护病房（九病室重症监护病房）和呼吸专科门诊，拥有住院床位85张；实验研究板块包含呼吸系统疾病研究室和医学实验中心，设立了实验动物饲养、动物缺氧和染毒、呼吸力学与机能检测、细胞培养、生化免疫、分子生物学、PCR检测、病理与图像分析等实验研究单元；专科检查板块包含肺功能室、睡眠呼吸监测室、支气管镜室、变态反应室等专科检查室；学科拥有临床用房3000M2和实验科研用房1000M2，现有各类先进科研设备和仪器30多套，价值人民币1000多万元。

呼吸内科现有、主任医师2人，副主任医师2人，主治医师2人，住院医师4人，拥有博士学位2人，拥有硕士学位8人；技术梯队职称结构、学历结构、知识结构、年龄结构，形成了一支技术力量雄厚、发展势头强劲的创新团队。临床诊疗水平先进，尤其在慢性阻塞性肺疾病、低氧性肺动脉高压、支气管哮喘等呼吸系统疾病领域已达到省内领先水平，部分已达国内先进水平。学科长期以慢性阻塞性肺疾病、低氧性肺动脉高压、支气管哮喘等重大呼吸系统疾病作为主要研究方向，科研水平达到国内先进，部分达国内领先、先进水平。