内二科包括消化、呼吸两个专业组。消化专业治疗食管癌、反流性食管炎、食管裂孔疝、急慢性胃炎、胃及十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、胃肠息肉、胰腺炎、肝硬化、脂肪肝、胆囊炎、消化道出血等。内二科专业诊治急慢性支气管炎、肺炎、支气管哮喘、肺心病、支气管扩张、肺脓肿、肺癌、肺结核、胸膜结核、脓胸、气胸等呼吸系统疾病。

科室率先在户县地区开展了胃镜、肠镜及支气管镜的诊断检查治疗，成功的开展了食管癌、食管狭窄、贲门失驰缓症扩张、钛镍合金支架置入、食管静脉破裂出血止血治疗、胃息肉和肠息肉电切、食管和胃内异物取出、逆行胰胆管造影、胆总管结石取出、超声导向下肿瘤细胞穿刺诊断、支气管镜下活检、刷检、穿透支气管壁肺活检、肺泡灌洗、气管和支气管内异物取出、胸膜活检、支气管镜下止血等。先进的电子胃镜，痛苦小，图象清晰，诊断准确。