内分泌科是福建省医学会糖尿病学分会创建单位及挂靠单位，福建医科大学代谢病研究室挂靠单位。学科带头人杨立勇系福建医科大学附属医院院长兼党委书记，特殊津贴，中华医学会糖尿病学分会常委、中国医师协会内分泌代谢医师分会常务委员、福建省医学会糖尿病学分会前任主任委员、美国糖尿病协会会员、福建省内科学分会副主任委员。

科室有病床50张，设有内分泌实验室、骨矿物测量室。现有医师14人，其中主任医师、4人，副主任医师、副6人；博硕士9人；博士生导师2人，硕士生导师4人。科室拥有一批年富力强、团结进取的医疗科研骨干队伍，承担和国内多项多中心研究项目，主持自然基金、中华医学会基金、卫生部和福建省多项科研课题，在国内外刊物上发表学术论文100多篇；主编和参编10多部专著。先后获科技成果奖13项。为批准的内科学内分泌专业博士授权点，已培养近百名博硕士研究生。承办多届级继续医学教育项目。