齐齐哈尔市第二医院小儿外科是齐市及省西部地区的一家小儿外科诊疗科室，它是集诊断及治疗为一体的诊疗中心，其技术力量居省内一流。在一些小儿疑难病症的诊治上，已达到国内先进水平。2007年二院小儿外科成功为一个出生9天，体重仅1500克的早产儿实施了空肠近端膜状闭销手术，这是迄今为止黑龙江省抢救成活的轻体重的早产儿。科内医护人员曾多人次在香港中文威尔士亲王医院、北京儿童医院、上海新华医院进修学。能够独立完成先天性食管闭锁、膈、膈膨升先天肥厚性幽门狭窄、肠旋转不良、环状胰腺、十二指肠闭锁、肠闭锁及狭窄、肠重复畸形、脐膨出、腹裂、脐胎瘤、胎烘性腹膜炎、腹膜后肿物的手术。尤其胆道闭锁肝门空肠KASSI手术，胆总管囊肿、囊肿切除术，先天巨结肠ROUX—Y吻合，短空肠弧距型瓣抗反流术，先天巨结肠一期经肛结肠拖出术，先天性无肛治疗，新生儿肾积水，肾盂输尿管吻合术已达到国内先进水平。第二医院小儿外科全体医护人员承诺：用我们技术、爱心、真诚为所有患者服务，以少的医疗费用，用少的治疗时间，为患儿恢复健康，减轻家庭和社会的负担。