焦作市第二人民医院消化内科是以诊治肝胆及胃肠道等消化系统常见病、危重病和疑难病的专科，是焦作市特色学科。该科拥有河南省消化学会委员1人，省内镜学会委员1人，焦作市消化学会主任委员、3名副主任委员均在该科。

焦作市第二人民医院消化内科对食管炎、食管癌、慢性胃炎、溃疡病、胃癌、慢性肝炎、肝硬化、肝癌、胆结石、胆囊炎及黄疸、腹水、腹疼、腹泻、呕吐、便血的诊断积累了丰富的经验。在抢救消化道大出血、肝昏迷、暴发性肝功能衰竭、重症胰腺炎等急重症的成功率达90%以上，用中西药灌肠治疗溃疡性结肠炎已达800余例。开展的贲门失驰缓症、食管狭窄的扩张术及支架置入，肝硬化、门脉高压食管静脉曲张破裂出血的套扎治疗，B超引导下治疗肝囊肿，肝脓肿，介入治疗肝、胃肠道肿瘤等技术达国内先进技术。该科实验室对抗生素及化疗引起的腹泻，可通过大便涂片快速诊断菌群失调的种类和程度，进一步指导临床治疗。