该院肿瘤科为扬州市临床重点专科。目前能开展胃癌、肝癌、食管癌、肺癌、胰腺癌、结直肠癌、宫颈癌、乳腺癌、淋巴瘤等及血液系统各种常见病、多发病的放射治疗、化学治疗、中医药治疗，包括近年发展迅速的分子靶向药物治疗，具有丰富的临床经验。在仪征市率先开展了输液泵持续化疗、便携式化疗泵、热疗、胸腹腔内灌注、单腔静脉导管闭式引流等先进技术。近年来又开展了经外周静脉置入中心静脉导管术（PICC）、超声引导下改良型赛丁格PICC穿刺术，不仅减少了患者因反复穿刺而带来的痛苦，更重要的是可以避免化疗药物对外周静脉的破坏和局部组织的刺激，化疗过程的顺利完成。

科室经过多年的临床实践，积累了丰富的临床经验，根据患者病情和病种的不同，个体化选择治疗方案，开展了同步放化疗、序贯放化疗、辅助放化疗、新辅助化疗、姑息放化疗、微波治疗、生物治疗、基因药物治疗等多种治疗模式。与南京大学合作成立了“仪征肿瘤放疗研究中心”，为该科放射治疗实现定位、设计、摆位、治疗提供了技术支持，使肿瘤的治疗达到限度地杀伤肿瘤细胞，小范围减少正常组织损伤的疗效。与江苏省肿瘤医院合作的定期会诊制度提升了科室人员的放疗技术水平，减轻了患者经济负担，使患者在该院就可得到省肿瘤医院的诊疗技术。