北京怀柔医院内分泌科成立于2004年3月，短短的10年，已经成为医院的特色科室。2012年风湿免疫科并入内分泌科。内分泌风湿科现有病床40张，医护人员30人，其中主任医师1人，副主任医师3人，主治医师5人，住院医师3人，其中硕士研究生5人。内分泌风湿科主要收治糖尿病、甲状腺疾病、内分泌性高血压、肾上腺、垂体疾病、痛风、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎等患者。科室拥有vistaAVS多普勒诊断系统、DSA2000糖尿病检测仪、动态血压监测仪、胰岛素泵及动态血糖仪等设备。科室以高超的医疗技术、先进的医学检测设备和良好的医德竭诚为患者服务，受到来自怀柔及周边地区患者的广泛好评。

内分泌科多次获得怀柔区医院精神文明科室称号，并于2006年获得北京市学习型先进科室称号。内分泌风湿科主任阮丹杰是怀柔区内分泌学科带头人，北京内分泌学会委员，北京糖尿病协会理事。曾荣获北京市三八红旗手、北京市“十百千”百层次人才资助、北京市先进工作者称号，享受区知识分子特殊津贴。内分泌科注重人才培养，先后有多名医生到北京中日友好医院、北京大学医院、总医院、协和医院进修学习，集各家医院特色于一体。内分泌科在科研方面取得一定成绩，曾获区级立项课题3项，荣获怀柔区科技进步奖6项，其中一等奖1项、二等奖3项、三等奖2项。在杂志发表论文20余篇。