汕头第二附属医院儿科分三个病区，10个专业（新生儿专业；血液、肿瘤、免疫性疾病专业；肾脏、泌尿专业；心血管专业；儿童保健专业；普儿专业（呼吸、消化专业）；急救、神经专业；内分泌专业。

汕头第二附属医院儿科在临床医疗工作取得了较大的成绩，对小儿白血病等血液肿瘤性疾病，哮喘、川崎病、过敏性紫癜等免疫性疾病，新生儿疾病，肾脏病，呼吸和消化系统疾病等的治疗有很好的疗效，临床医疗技术、水平及服务态度得到了病人的认可，收治病人数逐年提高。

承担IVIG对重症感染淋巴细胞功能的调节作用研究等6项省级及市厅级科研课题。近三年主持完成的科研课题《小儿白血病临床治疗问题探讨及经济学评价》经广东省评审居国内领先水平获2001年汕头市科技进步二等奖；《儿科临床输血》经广东省评审达国内先进水平，获1999年汕头市科技进步二等奖；《静脉注射免疫球蛋白与丙型肝炎病毒传播的安全性及临床应用研究》，经广东省评审居国内领先水平，获1998年汕头市科技进步二等奖。