中国医学科学院肿瘤医院深圳医院药学部成立于2014年，是集门诊西药房、住院药房、静脉药物配置中心、临床药学室、西药库、输液库等多个工作小组为一体的重要医技部门，负责组织实施包括药品和试剂采购供应、药品调剂、静脉药物配置及开展药品不良反应监测、临床药学监护、用药指导等多项药事管理工作，配合肿瘤医院各临床科室开展肿瘤的预防、治疗、康复和教学、研究等工作。具有专业技术性、经济管理性和咨询指导等多方面的工作性质。临床药学室配有血药浓度监测仪等设备，可进行甲氨蝶呤、万古霉素、庆大霉素等药物的血药浓度监测，并将开展药物基因组学与抗肿瘤药物个体化用药等工作。药学部现有工作人员11人，其中职称1人，中级职称3人，初级职称7人。