消化内科是上海市第六人民医院东院特色专科，科室有主任医师4名、副主任医师6名，主治医师6名，其中博士生导师2名，博士7名、硕士12名，并拥有有一支高素质的护理队伍。学科梯队合理、基础扎实，专科特色彰显、学术氛围浓厚，承担自然科学基金以及上海市科委、市卫生局、上海交通大学等科研课题多项。总共拥有床位64张，具有独立病区及门诊。在临床诊疗技术方面，已逐步建立了一系列诊断和治疗消化系统常见病多发病的诊疗方案，拥有一系列比较全面成熟的消化系统疾病诊疗的临床路径，如各种胃炎、消化性溃疡、急慢性肝病、肝硬化、胃肠道肿瘤、急慢性胰腺炎、胆囊炎、炎症性肠病、功能性胃肠病的规范化诊疗等。对于急危重疑难疾病的抢救和治疗方面，如重症胰腺炎、消化道大出血、肝性脑病、重症肝炎、重症炎症性肠病等的诊疗等方面积累了丰富的经验，取得了良好的临床效果和成绩。曾先后在上海市第六人民医院东院发现了很多罕见及少见的消化系统疾病病种及其他系统疾病病种，解决了很多疑难病人的诊疗问题。具备完整的内窥镜中心及内窥镜洗消中心，可以开展常规胃肠镜检查及多种胃肠镜下介入微创治疗：如食管静脉曲张套扎及硬化治疗、食道狭窄扩张及支架植入术、消化道营养管植入、消化道异物取出、消化道肿瘤粒子植入术、消化道息肉的切除等。