辽阳市新生儿疾病筛查中心坐落在辽阳市妇幼保健所内。该中心于2004年经省卫生厅批准正式成立，负责全市两县、五区34家助产机构的新生儿疾病筛查工作，即新生儿先天性甲状腺功能低下（CH）和苯丙酮尿症（PKU）的筛查，先天听力障碍筛查。辽阳市新生儿疾病筛查中心内设三个独立机构——网络管理组、实验组、临床诊治组。网络管理组负责新筛网络管理、报表、血样传递与验收、可疑阳性患儿的召回、新筛技术培训等。实验组负责血样验收、血斑TSH和PHE含量测定、确定实验室筛查切值和可疑阳性病例，实验室室内质量控制等。临床诊治组负责阳性患儿的诊断、治疗和跟踪随访。辽阳市新生儿疾病筛查中心以其独特的管理模式、信得过的筛查质量深受省内及同行的赞誉，为此筛查中心被省卫生厅评为新筛工作单位。由助产机构、市新筛中心组成的筛查网络，使全地区新筛工作的管理实现了科学化、系统化，同时了血样传递绿色通道的畅通和可疑阳性患儿的顺利召回。自2004年至2005年底，全市筛查新生儿20000人，筛查出先天性甲低5例。目前，全市筛查率达到89%以上，位居全省前列。