医院病理科成立近二十年，由专业病理医师负责诊断，技术力量雄厚，与四川省人民医院病理科和成都军区总医院病理科在业务上常年保持联系，定期参加全国病理协会成都分会的疑难病病理读片会。病理诊断是医疗服务工作的中心环节，在医疗质量中起着重要作用，为临床医生的诊治提供重要依据。病理科现有病理专业毕业的诊断医师两名，均为主治病理医师以上职称，从事病理诊断工作十年以上，有扎实的理论基础和诊断经验，先后在全国核心医学期刊上发表论文十余篇。

目前，病理科拥有OLYMPUSBX41显微镜、BMJ—Ⅲ型病理组织包埋机、LELCARM2235切片机、YT—7FB型生物组织摊烤片机、TKD—ZPA超薄式细胞自动制片机、TKD—生物组织智能脱水机及DCSK—Ⅲ型超声波人体组织快速处理仪等设备，为病理检查和相关疾病的诊断提供了可靠。医院病理科是承担病理检查与诊断的一个特殊科室，诊断结果直接关系到医院的诊治水平。目前，病理科工作几乎面向临床所有科室，科室开展的检查项目有：常规活检（包括治疗性手术切除标本，诊断性手术切除标本，内镜活检标本，手术刮出活检标本，穿刺活检标本和自然脱落排除标本），细胞病理学检查是对病变部位自然脱落、刮取或穿刺获取的细胞进行涂片检查（包括脱落细胞学检查、组织印片细胞学检查、穿刺细胞学检查、刮取或刷取细胞学检查等）。